1.基因筛查
白细胞表面抗原（HLA）?B27是一种遗传标记物，会遗传给下一代，这也是强直性脊柱炎可以遗传的重要原因。亚洲人群，90%强直性脊柱炎患者HLA-B27阳性，因此，HLA-B27为诊断强直性脊柱炎的必查项目。但该项目不会转阴，没必要反复检查。2.监测病情活动指标
C反应蛋白（CRP）和血沉（ESR）是反应炎症水平的重要指标，检测值越高，说明炎症水平越高，病情控制越差。但必须注意，这两个指标特异性不强，出现感冒发烧、咳嗽等感染的情况，也会升高。
3.监测药物副作用指标
因为很多药物，比如柳氮磺胺吡啶、甲氨蝶呤、消炎止痛药等都可能出现肝毒性、肾毒性和骨髓抑制等副作用，因此，一定要定期监测肝功能、肾功能、血常规、尿常规，以早期发现药物副作用。
肝功能：主要指标为谷丙转氨酶和谷草转氨酶，升高提示肝功能损伤。
肾功能：主要指标为血肌酐，血肌酐超过正常上限，可能提示肾功能异常。
血常规：若出现骨髓抑制，可能出现白细胞、血红蛋白、血小板的下降。
尿常规：尿红细胞、尿蛋白两个指标最关键，若阳性，可能提示肾脏损伤。
4.评估局部病变指标（影像学检查）
骶髂关节磁共振/CT：强直性脊柱炎多从骶髂关节开始起病，完善骶髂关节磁共振或CT可以了解该处骨结构损害程度，评估病情。磁共振的优点：可显示急性炎症，如骨髓水肿，无放射线损伤，缺点是价格贵；CT优点：对关节面骨质结构显示清晰度优于磁共振，但对骨髓水肿显示不清。
髋关节磁共振/CT：髋关节也是强直性脊柱炎好发部位，有相关症状和体征，可进行检查。
脊柱（颈椎、胸椎、腰椎、骨盆）X线：可发现骨赘、骨桥、骨关节面破坏等病变，用于评估病情严重程度和治疗效果。
关节磁共振/CT：有外周关节受累，可进行检查。观察急性病变，首选磁共振；观察结构损伤，首选CT。
关节超声：有外周关节受累，可进行检查。优点：价格便宜，可反复检查，对人体无伤害。
5.使用生物制剂前应筛查的指标
乙肝三系：若有乙型肝炎病毒感染，在使用生物制剂过程中可能激活病毒复制，故需要检查。必要时检查乙肝DNA定量。
丙肝抗体：若有丙型肝炎病毒感染，在使用生物制剂过程中可能激活病毒复制，故需要检查。必要时检查丙肝RNA定量。
结核筛查：无症状的潜伏期结核感染非常常见，使用生物制剂，可能导致潜伏期不致病的结核菌致病，故需常规排除潜伏期结核感染。常用指标为TSPOT或PPD试验，若符合潜伏期结核感染，应预防性抗结核治疗6-9个月。
胸片/肺CT：排除一般的感染、肺结核和肿瘤性疾病，保证生物制剂的用药安全。
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